提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
2022中国国际名酒博览会启幕 世界酒文化在四川宜宾“碰杯”******
中新网宜宾12月17日电 (吴平华 单鹏)“酒都宜宾 和美世界”2022中国国际名酒博览会(简称酒博会)17日在四川宜宾开幕。500余名国内外行业专家、知名酒类企业家等嘉宾汇聚一堂,为推动世界美酒走进中国、中国美酒飘香世界注入活力。
开幕式上,宜宾市主要负责人在致辞中表示,中国国际名酒博览会连续多年举办,活动规模、经济效益、品牌效应持续提升,为世界名酒荟萃一堂、各类酒企展示形象、酿酒文明竞展芳华提供了广阔舞台。
“面向未来,世界名酒唯有携手共进。世界名酒的共同价值取向,无疑就是追求‘和美至善’。”中国酒业协会理事长宋书玉说,当前,处于长周期发展中的世界酒业,即将迎来新一轮战略机遇,“和美大同”将成为世界酒业发展的战略新方向,譬如从生态角度看,“和美大同”就是要保护好酿酒自然生态与酿酒微生态,将环境、原料、酿造构建起协调的绿色生态关系。
主宾国奥地利国家馆开馆。 杨予頔 摄本届酒博会设展区5万余平方米,以“世界十大烈酒产区”为主线,以名优白酒为主要展品,有奥地利国家馆、中国名酒展示区、国际名酒展示区、四川名酒展示区、其他产区名酒展示区等。作为本届酒博会主宾国,奥地利国家馆17日上午举行开馆仪式,由奥地利组织的16家相关企业进行展览展示。
据了解,本届酒博会举办地宜宾,拥有4000多年酿酒史,是多粮浓香型白酒的发源地。白酒产业作为宜宾市传统优势产业和核心支柱产业,呈现出稳步发展的良好态势。2021年,宜宾市白酒总产量70.3万千升,占四川省19.3%,占全国9.8%;营业收入1634.8亿元,占四川省50.34%,占全国27.1%。2022年,宜宾预计全年白酒企业营业收入将突破1800亿元。(完)
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